קרצינומה ממקור תא לא ידוע (Carcinoma of unknown Primary - CUP) הינה ממאירות קשה לטיפול. במחקר זה החוקרים בחנו את הפרופיל המולטי-אומי ותוצאי טיפול בו, וכן העריכו את רמת דיוק ההתאמה לטיפול. DNA חופשי (cell-free DNA - cfDNA) של הגידול שהופק מהרקמה או מהדם עבר ריצוף של הדור הבא (Next Generation Sequencing - NGS). נבדקים נבחרים עברו סיווג חיסוני מבוסס טרנסיקריפטום ו/או בדיקה אימונוהיסטוכימית לנוכחות ליגנד למוות תאי מתוכנן 1 (programmed cell death ligand 1 - PD-L1). הנבדקים יכלו לעבור הערכה על ידי ועדה להערכת הגידול ברובד המולקולרי (Molecular Tumor Board), אך הרופאים המטפלים בחרו בגישה הטיפולית.
עוד בעניין דומה
מתוך 6,497 נבדקים במאגר הנתונים המדוייק, ל-97 היה CUP. תוצאות המחקר הדגימו כי מספר השינויים הגנומיים החציוני, עם פוטנציאל פוגעני, שנמצאו ברקמה עמד על 4 (טווח של 0-25) ושנמצאו ב-cfDNA עמד על 2 (טווח של 0-9). לכל אחד מהנבדקים היה נוף מולקולרי ייחודי. כאשר נבדקו סמנים ביולוגיים המאושרים לבדיקה על ידי ה-FDAי(Food and Drug Administration) מצאו כי 30.9% מגידולים מסוג CUP הדגימו רמות מוגברות של PD-L1 (1% ומעלה), 3.6% הדגימו אי-יציבות של מיקרוסטליטיים, 23% הדגימו נטל מוטציוני בגידול בשיעור של 10 מוטציות ומעלה לכל מליון בסיסים (megabase-mb), 0% הדגימו הצמדה של טירוזין קינאזות של קולטנים נוירוטרופיים (neurotrophic receptor tyrosine kinase - NRTK). אימונוגרמות מבוססות RNA הדגימו מספר מוקדים אפשריים להתערבות תרופתית: LAG-3י (Lymphocyte Activation Gene 3 protein), CSF1Rי(macrophage colony-stimulating factor 1 receptor), ADORA2י(adenosine receptor A2) ו-IDO1י(indoleamine2,3-dioxygenase 1).
בסך הכל 56% מהנבדקים הדגימו לפחות סמן ביולוגי אחד המשפיע על הטיפול (actionable biomarker, על פי מאגר OncoKB). על מנת לכמת את דרגת ההתאמה בין סוג הגידול לבין הטיפול, החוקרים חישבו ציון התאמה (Matching score - MS; מקביל למספר השינויים שהתמקדו בהם/סך השינויים הפוגעניים) לאחר סיום המחקר (post-hoc). כאשר השוו בין מטופלים ברי-הערכה שקיבלו טיפול בקבוצה עם MS גבוה - 50%< [n=15] לעומת אלו בקבוצה עם MS נמוך 50%≤ [n=47], מצאו כי המשך החציוני של שרידות ללא התקדמות מחלה עמד על 10.4 לעומת 2.8 חודשים (רווח בר-סמך של 95%, 0.11-0.64; יחס סיכונים של 0.27, p=0.002), המשך החציוני של שרידות כוללת עמד על 15.8 לעומת 6.9 חודשים (רווח בר-סמך של 95%, 0.17-1.16, יחס סיכונים של 0.45, p=0.09) ושיעור התועלת הקלינית (נמדד לפי משך מחלה יציבה של שישה חודשים ומעלה/תגובה חלקית או מלאה לטיפול) עמד על 71% לעומת 24% (p=0.003). בניתוח רב משתני נמצא כי MS גבוה יותר נמצא כגורם היחיד המנבא שיפור בתוצאים.
מסקנת החוקרים הייתה כי CUP הינם גידולים מורכבים מבחינה מולקולרית. טיפולים עם התאמה רבה בין שינויים מולקולריים (לרוב הוסג על ידי תשלובות ייחודיות) נמצא קשור לשיפור בתוצאים.
מקור: