השבתת השירותים הפדראליים בארה"ב (Shutdown) פגעה גם ב-CDC: המרכז לבקרת מחלות ומניעתן שלח הביתה 68% מעובדיו – 8,754 בני אדם - בדיוק כאשר מתחילה עונת השפעת. המרכז האמריקאי משמש בין השאר כגוף המעקב אחרי התפשטות מחלות ואנשיו נכנסים לפעולה כדי לנהל כל משבר בריאותי, גם מחוץ לארה"ב.
עוד בעניין דומה
מעשית, בעקבות ההשבתה, נסגרו מעבדות ה-CDC שבהן מזהים זנים של נגיפים מחוללי מחלות ומגלים מוטציות חדשות. לכך יש השלכות נוספות, משום שפעילות מחקרית-מעבדתית זאת מאפשרת לקבוע מדי שנה את הרכבי החיסונים, כדי שיותאמו לזני הנגיפים הפעילים.
קיים חשש, למשל, שזן נגיף שפעת העופות H7N9 האלים והקטלני, שהתגלה בתחילת השנה בסין, יגיע לארה"ב ולא יזוהה מוקדם מספיק לצורך תגובה. עד כה, הנגיף לא הראה יכולת הדבקה והעברה מהירה בין בני אדם.
כמו כן, הביעו אנשי ה-CDC חשש כי עם תימשך ההשבתה, תשובש התקשורת ושיתופי הפעולה המקצועיים שבין המרכז לבין עמיתיהם בשאר העולם וגם עם ארגון הבריאות העולמי. ה-WHO תלוי בסיוע כספי מה-CDC כדי להכחיד את הפוליו במסגרת תוכנית כלל-עולמית בשם Global Disease Detection .